در میان اساتید حوزه رئیس سازمان پژوهش و برنامه‌ریزی آموزشی، علی لطیفی به عنوان فردی اثرگذار شناخته می‌شود. ایشان دارای مدرک دکتری فلسفه تعلیم و تربیت است که پشتوانه‌ای علمی برای آموزش‌های او فراهم آورده است. در کنار فعالیت‌های علمی، ایشان به عنوان عضو شورای پژوهشی پژوهشکده تعلیم و تربیت اسلامی و همچنین مؤسس و مدیر پژوهشکده تعلیم و تربیت اسلامی نیز فعالیت کرده است. همچنین به عنوان عضو هیئت مؤسس اعضای وابسته شورا, اعضای کمیسیون کمیته مدارس علوم و معارف اسلامی و همچنین اعضای کمیسیون راهبری تحول بنیادین نقش‌آفرینی داشته است. از فعالیت‌های علمی او می‌توان به تالیف کتاب مبانی فلسفه : علم تربیت اسلامی ، منطقی، معرفت شناختی و وجود شناختی نظریه اعتباریات علامه طباطبایی اشاره کرد.